Upload ftp onde coloco a pasta com os dados

fiz a instalação do ojs via wamp. está funcionando. agora quero fazer o upload. para upload estou utilizando o FileZilla. meu domínio está registrado na locaweb. verifiquei que a pasta com banco de dados está fora da pasta OJS no wamp. como devo proceder o upload? mantenho ele fora? coloco ele dentro da pasta OJS?